Le mouvement étudiant dénonce le caractère plébiscitaire de la consultation « pour la régionalisation et la réforme du Sénat » fixée au 27 avril 1969 et appelle à voter « non ». Il souligne toutefois que ce référendum n’engage pas les forces du mouvement étudiant qui continue à se concentrer sur la lutte contre la participation.

Tandis que le Congrès adopte massivement les « 17 thèses  » qui étaient soumises à sa discussion, il se divise sur la question du référendum d’avril ; le boycott de la consultation préconisé par le bureau national, position commune de Michel Rocard et de Marc Heurgon, est mis en minorité : une majorité de délégués a considéré que le refus de cette consultation n’était pas possible et a préconisé le vote « non ». Les sections étudiantes ont majoritairement penché pour le « non ». Un débat autour des nouvelles classes sociales obligeant le Parti à envisager de nouvelles méthodes et formes d’action a été ouvert par Manuel Bridier, Alain Badiou et André Garnier. À l’issue de ce congrès difficile, Marc Heurgon renonce à ses fonctions de secrétaire à l’organisation. Ne se sont pas représentés également Christian Guerche et Jean-François Pertus. Michel Rocard reste secrétaire national.

Dans l’éditorial du Numéro 1 de « Sorbonne Action » de la section ESU Sorbonne-Lettres, le Secrétaire de la Section J.L.Triaud dit Non au référendum.  Le choix n’est pas entre la 5ème ou la 4ème République : « On nous demande de choisir entre une monarchie absolue (Constitution de 58) « améliorée » et une monarchie « tempérée » (Constitution de 58 sans changement)… « Le peuple préfère-t-il être jeté par la fenêtre du 20ème ou du 15ème étage ? Le peuple ne veut pas être jeté par la fenêtre du tout !!! »

Pour la négociation immédiate pour la paix en Algérie, contre les supercheries du référendum, contre le pouvoir gaulliste, le P.S.U. appelle à un grand meeting le vendredi 6 janvier. Gilles Martinet dans l’éditorial de Tribune Socialiste démontre que la mise en place du référendum n’est qu’un moyen pour le gouvernement gaulliste de retarder la paix et les négociations. C’est par opposition à toutes les tergiversations gouvernementales que le P.S.U. choisit le « Non » au référendum. Charles Lussy dans un article connexe dénonce l’usage du référendum qui n’est en fait qu’un plébiscite et un chantage de la part de De Gaulle comme en 1958.